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半胱氨酸（cysteine；Cys）的化學名稱為2-氨基-3-巰基丙酸，它是脂肪族含巰基的極性α-氨基酸。半胱氨酸是人體的條件必需氨基酸和生糖氨基酸，可由體內的蛋氨酸（甲硫氨酸，人體必需氨基酸）轉化而來，可與胱氨酸互相轉化。 ^[3] 

HSCH2CH（NH2）COOH，(C3H7NSO2)為含硫α-氨基酸之一，遇硝普鹽（nitroprusside）呈紫色（因SH而顯色），存在于許多蛋白質、谷胱甘肽中，與Ag+，Hg+，Cu+等金屬離子可形成不溶性的硫醇鹽（mercaptide）。即R－S－M′， R－S－M″－S－R（M′， M″各為1價、2價金屬）。半胱氨酸屬于非必需氨基酸。在動物體內是從蛋氨酸和絲氨酸經過胱硫醚而合成。無機硫黃(來自硫酸鹽)導入到半胱氨酸，在植物和細菌中,從硫酸經過3'-磷酸腺苷-5'-磷酸硫酸和亞硫酸還原生成的H2S通過和O-乙酰絲氨酸或絲氨酸反應而生成。

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